Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CNGB1Q14028 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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