Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CKAP5Q14008 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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