Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PDE6HQ13956 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
PDE6HQ13956 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
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PDE6HQ13956 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE6HQ13956 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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