Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CCINQ13939 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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