Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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