Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ITGA9Q13797 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ITGA9Q13797 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ITGA9Q13797 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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