Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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