Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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