Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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