Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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