Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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