Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TOP3AQ13472 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
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