Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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