Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3BQ13214 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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SEMA3BQ13214 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3BQ13214 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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