Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPS1Q13098 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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