Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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