Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNTN1Q12860 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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