Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms