Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRDP23468 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRDP23468 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRDP23468 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRDP23468 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRDP23468 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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