Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CRXO43186 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CRXO43186 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CRXO43186 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CRXO43186 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CRXO43186 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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