Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms