Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM35Q9UPQ4 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRIM35Q9UPQ4 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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