Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GTF3C6Q969F1 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GTF3C6Q969F1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms