Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLIP4Q8N3C7 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLIP4Q8N3C7 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLIP4Q8N3C7 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLIP4Q8N3C7 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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