Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRRC9Q6ZRR7 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LRRC9Q6ZRR7 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms