Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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