Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms