Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCDC96Q2M329 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms