Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
FAM187BQ17R55 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms