Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF239Q16600 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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