Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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