Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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