Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
USF2Q15853 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
USF2Q15853 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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