Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PCOLCEQ15113 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.7 ms