Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms