Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC3Q15034 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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