Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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SHPRHQ149N8 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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SHPRHQ149N8 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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SHPRHQ149N8 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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SHPRHQ149N8 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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SHPRHQ149N8 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHPRHQ149N8 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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