Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMC1AQ14683 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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