Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARB2Q14108 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms