Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CCINQ13939 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CCINQ13939 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CCINQ13939 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms