Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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