Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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CUL1Q13616 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CUL1Q13616 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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CUL1Q13616 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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