Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms