Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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PICALMQ13492 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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PICALMQ13492 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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PICALMQ13492 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PICALMQ13492 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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