Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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