Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
XRCC4Q13426 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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