Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CBX3Q13185 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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