Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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NR1H3Q13133 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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NR1H3Q13133 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NR1H3Q13133 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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