Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1BQ13112 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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