Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
STRN3Q13033 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.4 ms